Protein–RNA interactions for Protein: Q96PQ0

SORCS2, VPS10 domain-containing receptor SorCS2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS2Q96PQ0 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SORCS2Q96PQ0 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SORCS2Q96PQ0 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms