Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC7Q96M83 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC7Q96M83 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms