Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 UBE3A-226ENST00000637886 8725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 GFAP-214ENST00000588735 6538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 NRP2-204ENST00000360409 6662 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC00208Q96KT6 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms