Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD0

PDXP, Pyridoxal phosphate phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDXPQ96GD0 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PDXPQ96GD0 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PDXPQ96GD0 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDXPQ96GD0 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDXPQ96GD0 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDXPQ96GD0 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDXPQ96GD0 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDXPQ96GD0 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDXPQ96GD0 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDXPQ96GD0 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDXPQ96GD0 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDXPQ96GD0 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDXPQ96GD0 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDXPQ96GD0 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDXPQ96GD0 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDXPQ96GD0 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDXPQ96GD0 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDXPQ96GD0 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDXPQ96GD0 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDXPQ96GD0 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDXPQ96GD0 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDXPQ96GD0 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDXPQ96GD0 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDXPQ96GD0 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDXPQ96GD0 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDXPQ96GD0 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDXPQ96GD0 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDXPQ96GD0 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDXPQ96GD0 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDXPQ96GD0 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDXPQ96GD0 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDXPQ96GD0 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDXPQ96GD0 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDXPQ96GD0 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDXPQ96GD0 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDXPQ96GD0 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDXPQ96GD0 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDXPQ96GD0 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PDXPQ96GD0 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PDXPQ96GD0 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PDXPQ96GD0 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDXPQ96GD0 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PDXPQ96GD0 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDXPQ96GD0 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PDXPQ96GD0 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDXPQ96GD0 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDXPQ96GD0 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDXPQ96GD0 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDXPQ96GD0 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDXPQ96GD0 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDXPQ96GD0 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDXPQ96GD0 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDXPQ96GD0 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDXPQ96GD0 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDXPQ96GD0 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDXPQ96GD0 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PDXPQ96GD0 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDXPQ96GD0 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDXPQ96GD0 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDXPQ96GD0 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDXPQ96GD0 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDXPQ96GD0 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDXPQ96GD0 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDXPQ96GD0 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDXPQ96GD0 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDXPQ96GD0 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDXPQ96GD0 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDXPQ96GD0 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDXPQ96GD0 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDXPQ96GD0 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDXPQ96GD0 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDXPQ96GD0 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDXPQ96GD0 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDXPQ96GD0 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDXPQ96GD0 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDXPQ96GD0 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDXPQ96GD0 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDXPQ96GD0 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDXPQ96GD0 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDXPQ96GD0 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDXPQ96GD0 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDXPQ96GD0 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDXPQ96GD0 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDXPQ96GD0 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDXPQ96GD0 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDXPQ96GD0 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDXPQ96GD0 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDXPQ96GD0 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDXPQ96GD0 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDXPQ96GD0 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDXPQ96GD0 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDXPQ96GD0 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDXPQ96GD0 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDXPQ96GD0 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDXPQ96GD0 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDXPQ96GD0 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PDXPQ96GD0 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDXPQ96GD0 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDXPQ96GD0 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDXPQ96GD0 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms