Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM3DQ96BQ1 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM3DQ96BQ1 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM3DQ96BQ1 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM3DQ96BQ1 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM3DQ96BQ1 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM3DQ96BQ1 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM3DQ96BQ1 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM3DQ96BQ1 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM3DQ96BQ1 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM3DQ96BQ1 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM3DQ96BQ1 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM3DQ96BQ1 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM3DQ96BQ1 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM3DQ96BQ1 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM3DQ96BQ1 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM3DQ96BQ1 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM3DQ96BQ1 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM3DQ96BQ1 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM3DQ96BQ1 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM3DQ96BQ1 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM3DQ96BQ1 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM3DQ96BQ1 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM3DQ96BQ1 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM3DQ96BQ1 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM3DQ96BQ1 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM3DQ96BQ1 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM3DQ96BQ1 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM3DQ96BQ1 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM3DQ96BQ1 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM3DQ96BQ1 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM3DQ96BQ1 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM3DQ96BQ1 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM3DQ96BQ1 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM3DQ96BQ1 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM3DQ96BQ1 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM3DQ96BQ1 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM3DQ96BQ1 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM3DQ96BQ1 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM3DQ96BQ1 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM3DQ96BQ1 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM3DQ96BQ1 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM3DQ96BQ1 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM3DQ96BQ1 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM3DQ96BQ1 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM3DQ96BQ1 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM3DQ96BQ1 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM3DQ96BQ1 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM3DQ96BQ1 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM3DQ96BQ1 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM3DQ96BQ1 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM3DQ96BQ1 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM3DQ96BQ1 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM3DQ96BQ1 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM3DQ96BQ1 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM3DQ96BQ1 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM3DQ96BQ1 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM3DQ96BQ1 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM3DQ96BQ1 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM3DQ96BQ1 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM3DQ96BQ1 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM3DQ96BQ1 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM3DQ96BQ1 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM3DQ96BQ1 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM3DQ96BQ1 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM3DQ96BQ1 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM3DQ96BQ1 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM3DQ96BQ1 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM3DQ96BQ1 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM3DQ96BQ1 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM3DQ96BQ1 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM3DQ96BQ1 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM3DQ96BQ1 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM3DQ96BQ1 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM3DQ96BQ1 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM3DQ96BQ1 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM3DQ96BQ1 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM3DQ96BQ1 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM3DQ96BQ1 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM3DQ96BQ1 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM3DQ96BQ1 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM3DQ96BQ1 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM3DQ96BQ1 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM3DQ96BQ1 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM3DQ96BQ1 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM3DQ96BQ1 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM3DQ96BQ1 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM3DQ96BQ1 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM3DQ96BQ1 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM3DQ96BQ1 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM3DQ96BQ1 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM3DQ96BQ1 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM3DQ96BQ1 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM3DQ96BQ1 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM3DQ96BQ1 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM3DQ96BQ1 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM3DQ96BQ1 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM3DQ96BQ1 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM3DQ96BQ1 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FAM3DQ96BQ1 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms