Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBW4

SLC38A9, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 9, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A9Q8NBW4 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SLC38A9Q8NBW4 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC38A9Q8NBW4 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC38A9Q8NBW4 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC38A9Q8NBW4 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC38A9Q8NBW4 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC38A9Q8NBW4 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC38A9Q8NBW4 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC38A9Q8NBW4 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC38A9Q8NBW4 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC38A9Q8NBW4 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC38A9Q8NBW4 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC38A9Q8NBW4 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC38A9Q8NBW4 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC38A9Q8NBW4 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC38A9Q8NBW4 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC38A9Q8NBW4 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC38A9Q8NBW4 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC38A9Q8NBW4 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC38A9Q8NBW4 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC38A9Q8NBW4 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC38A9Q8NBW4 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC38A9Q8NBW4 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC38A9Q8NBW4 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC38A9Q8NBW4 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC38A9Q8NBW4 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC38A9Q8NBW4 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC38A9Q8NBW4 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC38A9Q8NBW4 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC38A9Q8NBW4 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC38A9Q8NBW4 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC38A9Q8NBW4 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC38A9Q8NBW4 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC38A9Q8NBW4 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC38A9Q8NBW4 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC38A9Q8NBW4 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC38A9Q8NBW4 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC38A9Q8NBW4 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC38A9Q8NBW4 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SLC38A9Q8NBW4 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC38A9Q8NBW4 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC38A9Q8NBW4 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC38A9Q8NBW4 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC38A9Q8NBW4 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC38A9Q8NBW4 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC38A9Q8NBW4 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC38A9Q8NBW4 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC38A9Q8NBW4 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC38A9Q8NBW4 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC38A9Q8NBW4 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC38A9Q8NBW4 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC38A9Q8NBW4 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC38A9Q8NBW4 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC38A9Q8NBW4 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC38A9Q8NBW4 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC38A9Q8NBW4 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC38A9Q8NBW4 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC38A9Q8NBW4 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC38A9Q8NBW4 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC38A9Q8NBW4 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms