Protein–RNA interactions for Protein: Q8N944

AMER3, APC membrane recruitment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER3Q8N944 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMER3Q8N944 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMER3Q8N944 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMER3Q8N944 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMER3Q8N944 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMER3Q8N944 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMER3Q8N944 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMER3Q8N944 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMER3Q8N944 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMER3Q8N944 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMER3Q8N944 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMER3Q8N944 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMER3Q8N944 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMER3Q8N944 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMER3Q8N944 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMER3Q8N944 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMER3Q8N944 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMER3Q8N944 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMER3Q8N944 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMER3Q8N944 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMER3Q8N944 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMER3Q8N944 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMER3Q8N944 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
AMER3Q8N944 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMER3Q8N944 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMER3Q8N944 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMER3Q8N944 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMER3Q8N944 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
AMER3Q8N944 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMER3Q8N944 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMER3Q8N944 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
AMER3Q8N944 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMER3Q8N944 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMER3Q8N944 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMER3Q8N944 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMER3Q8N944 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMER3Q8N944 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMER3Q8N944 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMER3Q8N944 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
AMER3Q8N944 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMER3Q8N944 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMER3Q8N944 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMER3Q8N944 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMER3Q8N944 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMER3Q8N944 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMER3Q8N944 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMER3Q8N944 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMER3Q8N944 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMER3Q8N944 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMER3Q8N944 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMER3Q8N944 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMER3Q8N944 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMER3Q8N944 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AMER3Q8N944 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMER3Q8N944 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMER3Q8N944 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMER3Q8N944 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMER3Q8N944 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMER3Q8N944 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMER3Q8N944 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMER3Q8N944 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMER3Q8N944 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMER3Q8N944 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMER3Q8N944 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMER3Q8N944 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMER3Q8N944 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMER3Q8N944 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AMER3Q8N944 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMER3Q8N944 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMER3Q8N944 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMER3Q8N944 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMER3Q8N944 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMER3Q8N944 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AMER3Q8N944 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AMER3Q8N944 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMER3Q8N944 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMER3Q8N944 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMER3Q8N944 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMER3Q8N944 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMER3Q8N944 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMER3Q8N944 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMER3Q8N944 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMER3Q8N944 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMER3Q8N944 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMER3Q8N944 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMER3Q8N944 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMER3Q8N944 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMER3Q8N944 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AMER3Q8N944 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMER3Q8N944 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMER3Q8N944 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMER3Q8N944 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMER3Q8N944 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMER3Q8N944 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMER3Q8N944 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMER3Q8N944 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMER3Q8N944 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMER3Q8N944 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMER3Q8N944 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMER3Q8N944 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms