Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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CLIP4Q8N3C7 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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CLIP4Q8N3C7 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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CLIP4Q8N3C7 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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CLIP4Q8N3C7 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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CLIP4Q8N3C7 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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CLIP4Q8N3C7 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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CLIP4Q8N3C7 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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CLIP4Q8N3C7 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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CLIP4Q8N3C7 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLIP4Q8N3C7 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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