Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ3

C9orf40, Uncharacterized protein C9orf40, humanhuman

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40Q8IXQ3 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
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C9orf40Q8IXQ3 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
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C9orf40Q8IXQ3 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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C9orf40Q8IXQ3 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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C9orf40Q8IXQ3 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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