Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms