Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7G1

CLNK, Cytokine-dependent hematopoietic cell linker, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLNKQ7Z7G1 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLNKQ7Z7G1 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLNKQ7Z7G1 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLNKQ7Z7G1 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLNKQ7Z7G1 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLNKQ7Z7G1 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLNKQ7Z7G1 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLNKQ7Z7G1 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLNKQ7Z7G1 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLNKQ7Z7G1 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLNKQ7Z7G1 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLNKQ7Z7G1 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLNKQ7Z7G1 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLNKQ7Z7G1 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CLNKQ7Z7G1 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLNKQ7Z7G1 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLNKQ7Z7G1 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLNKQ7Z7G1 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLNKQ7Z7G1 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLNKQ7Z7G1 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLNKQ7Z7G1 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLNKQ7Z7G1 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLNKQ7Z7G1 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLNKQ7Z7G1 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLNKQ7Z7G1 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLNKQ7Z7G1 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLNKQ7Z7G1 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLNKQ7Z7G1 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLNKQ7Z7G1 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLNKQ7Z7G1 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLNKQ7Z7G1 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLNKQ7Z7G1 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLNKQ7Z7G1 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLNKQ7Z7G1 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CLNKQ7Z7G1 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLNKQ7Z7G1 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLNKQ7Z7G1 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLNKQ7Z7G1 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLNKQ7Z7G1 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLNKQ7Z7G1 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLNKQ7Z7G1 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CLNKQ7Z7G1 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CLNKQ7Z7G1 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLNKQ7Z7G1 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLNKQ7Z7G1 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLNKQ7Z7G1 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLNKQ7Z7G1 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLNKQ7Z7G1 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLNKQ7Z7G1 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLNKQ7Z7G1 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLNKQ7Z7G1 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLNKQ7Z7G1 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLNKQ7Z7G1 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLNKQ7Z7G1 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLNKQ7Z7G1 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLNKQ7Z7G1 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLNKQ7Z7G1 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CLNKQ7Z7G1 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLNKQ7Z7G1 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLNKQ7Z7G1 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLNKQ7Z7G1 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLNKQ7Z7G1 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLNKQ7Z7G1 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLNKQ7Z7G1 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLNKQ7Z7G1 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLNKQ7Z7G1 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLNKQ7Z7G1 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLNKQ7Z7G1 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLNKQ7Z7G1 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLNKQ7Z7G1 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLNKQ7Z7G1 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLNKQ7Z7G1 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLNKQ7Z7G1 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLNKQ7Z7G1 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLNKQ7Z7G1 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLNKQ7Z7G1 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLNKQ7Z7G1 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLNKQ7Z7G1 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLNKQ7Z7G1 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLNKQ7Z7G1 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLNKQ7Z7G1 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLNKQ7Z7G1 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CLNKQ7Z7G1 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLNKQ7Z7G1 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLNKQ7Z7G1 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLNKQ7Z7G1 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLNKQ7Z7G1 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLNKQ7Z7G1 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLNKQ7Z7G1 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLNKQ7Z7G1 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLNKQ7Z7G1 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CLNKQ7Z7G1 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms