Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVN7

SEM1, Putative protein SEM1, isoform 2, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEM1Q6ZVN7 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SEM1Q6ZVN7 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEM1Q6ZVN7 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEM1Q6ZVN7 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEM1Q6ZVN7 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEM1Q6ZVN7 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SEM1Q6ZVN7 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SEM1Q6ZVN7 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEM1Q6ZVN7 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEM1Q6ZVN7 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEM1Q6ZVN7 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEM1Q6ZVN7 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEM1Q6ZVN7 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEM1Q6ZVN7 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEM1Q6ZVN7 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEM1Q6ZVN7 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEM1Q6ZVN7 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEM1Q6ZVN7 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEM1Q6ZVN7 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEM1Q6ZVN7 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEM1Q6ZVN7 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEM1Q6ZVN7 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEM1Q6ZVN7 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SEM1Q6ZVN7 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEM1Q6ZVN7 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEM1Q6ZVN7 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEM1Q6ZVN7 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEM1Q6ZVN7 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEM1Q6ZVN7 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEM1Q6ZVN7 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SEM1Q6ZVN7 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEM1Q6ZVN7 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEM1Q6ZVN7 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEM1Q6ZVN7 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEM1Q6ZVN7 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEM1Q6ZVN7 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEM1Q6ZVN7 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEM1Q6ZVN7 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEM1Q6ZVN7 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEM1Q6ZVN7 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEM1Q6ZVN7 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEM1Q6ZVN7 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEM1Q6ZVN7 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEM1Q6ZVN7 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEM1Q6ZVN7 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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SEM1Q6ZVN7 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEM1Q6ZVN7 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEM1Q6ZVN7 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEM1Q6ZVN7 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEM1Q6ZVN7 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEM1Q6ZVN7 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEM1Q6ZVN7 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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SEM1Q6ZVN7 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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SEM1Q6ZVN7 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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SEM1Q6ZVN7 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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SEM1Q6ZVN7 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEM1Q6ZVN7 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEM1Q6ZVN7 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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SEM1Q6ZVN7 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEM1Q6ZVN7 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEM1Q6ZVN7 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEM1Q6ZVN7 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEM1Q6ZVN7 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEM1Q6ZVN7 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEM1Q6ZVN7 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEM1Q6ZVN7 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEM1Q6ZVN7 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEM1Q6ZVN7 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEM1Q6ZVN7 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEM1Q6ZVN7 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEM1Q6ZVN7 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEM1Q6ZVN7 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEM1Q6ZVN7 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEM1Q6ZVN7 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEM1Q6ZVN7 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEM1Q6ZVN7 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEM1Q6ZVN7 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEM1Q6ZVN7 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEM1Q6ZVN7 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEM1Q6ZVN7 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEM1Q6ZVN7 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEM1Q6ZVN7 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEM1Q6ZVN7 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEM1Q6ZVN7 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SEM1Q6ZVN7 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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