Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZBED9Q6R2W3 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms