Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ANKRD40Q6AI12 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms