Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWM4

PRAMEF8, PRAME family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF8Q5VWM4 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRAMEF8Q5VWM4 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF8Q5VWM4 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF8Q5VWM4 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF8Q5VWM4 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF8Q5VWM4 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF8Q5VWM4 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF8Q5VWM4 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF8Q5VWM4 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF8Q5VWM4 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF8Q5VWM4 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF8Q5VWM4 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF8Q5VWM4 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF8Q5VWM4 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF8Q5VWM4 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF8Q5VWM4 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF8Q5VWM4 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF8Q5VWM4 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF8Q5VWM4 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF8Q5VWM4 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF8Q5VWM4 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF8Q5VWM4 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF8Q5VWM4 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF8Q5VWM4 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF8Q5VWM4 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF8Q5VWM4 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF8Q5VWM4 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF8Q5VWM4 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF8Q5VWM4 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF8Q5VWM4 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF8Q5VWM4 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF8Q5VWM4 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF8Q5VWM4 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF8Q5VWM4 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF8Q5VWM4 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF8Q5VWM4 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRAMEF8Q5VWM4 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRAMEF8Q5VWM4 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRAMEF8Q5VWM4 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PRAMEF8Q5VWM4 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRAMEF8Q5VWM4 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRAMEF8Q5VWM4 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRAMEF8Q5VWM4 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRAMEF8Q5VWM4 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRAMEF8Q5VWM4 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRAMEF8Q5VWM4 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRAMEF8Q5VWM4 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRAMEF8Q5VWM4 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRAMEF8Q5VWM4 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRAMEF8Q5VWM4 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRAMEF8Q5VWM4 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRAMEF8Q5VWM4 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRAMEF8Q5VWM4 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms