Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2W1

PDZK1, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF3, humanhuman

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Length 519 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1Q5T2W1 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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PDZK1Q5T2W1 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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PDZK1Q5T2W1 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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PDZK1Q5T2W1 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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PDZK1Q5T2W1 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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PDZK1Q5T2W1 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDZK1Q5T2W1 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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