Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV4

BRMS1L, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1LQ5PSV4 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BRMS1LQ5PSV4 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms