Protein–RNA interactions for Protein: Q5H8C1

FREM1, FRAS1-related extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FREM1Q5H8C1 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FREM1Q5H8C1 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms