Protein–RNA interactions for Protein: Q53EU6

GPAT3, Glycerol-3-phosphate acyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAT3Q53EU6 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPAT3Q53EU6 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPAT3Q53EU6 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms