Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM259Q4ZIN3 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms