Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY52

ZIK1, Zinc finger protein interacting with ribonucleoprotein K, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIK1Q3SY52 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZIK1Q3SY52 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ZIK1Q3SY52 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ZIK1Q3SY52 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ZIK1Q3SY52 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ZIK1Q3SY52 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ZIK1Q3SY52 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIK1Q3SY52 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIK1Q3SY52 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIK1Q3SY52 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIK1Q3SY52 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIK1Q3SY52 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIK1Q3SY52 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIK1Q3SY52 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIK1Q3SY52 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIK1Q3SY52 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIK1Q3SY52 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIK1Q3SY52 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIK1Q3SY52 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIK1Q3SY52 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIK1Q3SY52 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIK1Q3SY52 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIK1Q3SY52 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIK1Q3SY52 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIK1Q3SY52 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIK1Q3SY52 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIK1Q3SY52 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIK1Q3SY52 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIK1Q3SY52 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIK1Q3SY52 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIK1Q3SY52 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIK1Q3SY52 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIK1Q3SY52 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIK1Q3SY52 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIK1Q3SY52 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIK1Q3SY52 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIK1Q3SY52 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIK1Q3SY52 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIK1Q3SY52 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIK1Q3SY52 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIK1Q3SY52 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIK1Q3SY52 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIK1Q3SY52 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIK1Q3SY52 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIK1Q3SY52 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIK1Q3SY52 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIK1Q3SY52 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIK1Q3SY52 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIK1Q3SY52 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIK1Q3SY52 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIK1Q3SY52 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIK1Q3SY52 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIK1Q3SY52 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIK1Q3SY52 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIK1Q3SY52 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIK1Q3SY52 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIK1Q3SY52 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIK1Q3SY52 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIK1Q3SY52 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIK1Q3SY52 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIK1Q3SY52 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIK1Q3SY52 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms