Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI77

KRTAP13-4, Keratin-associated protein 13-4, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-4Q3LI77 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
KRTAP13-4Q3LI77 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.16
KRTAP13-4Q3LI77 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
KRTAP13-4Q3LI77 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
KRTAP13-4Q3LI77 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.16
KRTAP13-4Q3LI77 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.16
KRTAP13-4Q3LI77 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
KRTAP13-4Q3LI77 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP13-4Q3LI77 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP13-4Q3LI77 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP13-4Q3LI77 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP13-4Q3LI77 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP13-4Q3LI77 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP13-4Q3LI77 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP13-4Q3LI77 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP13-4Q3LI77 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP13-4Q3LI77 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP13-4Q3LI77 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP13-4Q3LI77 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP13-4Q3LI77 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP13-4Q3LI77 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP13-4Q3LI77 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP13-4Q3LI77 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP13-4Q3LI77 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP13-4Q3LI77 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP13-4Q3LI77 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP13-4Q3LI77 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP13-4Q3LI77 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP13-4Q3LI77 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP13-4Q3LI77 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP13-4Q3LI77 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP13-4Q3LI77 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP13-4Q3LI77 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP13-4Q3LI77 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP13-4Q3LI77 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP13-4Q3LI77 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP13-4Q3LI77 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP13-4Q3LI77 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP13-4Q3LI77 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP13-4Q3LI77 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP13-4Q3LI77 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP13-4Q3LI77 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP13-4Q3LI77 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP13-4Q3LI77 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP13-4Q3LI77 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP13-4Q3LI77 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP13-4Q3LI77 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP13-4Q3LI77 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP13-4Q3LI77 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP13-4Q3LI77 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP13-4Q3LI77 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP13-4Q3LI77 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP13-4Q3LI77 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP13-4Q3LI77 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP13-4Q3LI77 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP13-4Q3LI77 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP13-4Q3LI77 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP13-4Q3LI77 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP13-4Q3LI77 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP13-4Q3LI77 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP13-4Q3LI77 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP13-4Q3LI77 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP13-4Q3LI77 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP13-4Q3LI77 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP13-4Q3LI77 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP13-4Q3LI77 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP13-4Q3LI77 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP13-4Q3LI77 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP13-4Q3LI77 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP13-4Q3LI77 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP13-4Q3LI77 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP13-4Q3LI77 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP13-4Q3LI77 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP13-4Q3LI77 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP13-4Q3LI77 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP13-4Q3LI77 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP13-4Q3LI77 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP13-4Q3LI77 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP13-4Q3LI77 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP13-4Q3LI77 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP13-4Q3LI77 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP13-4Q3LI77 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP13-4Q3LI77 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP13-4Q3LI77 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP13-4Q3LI77 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP13-4Q3LI77 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP13-4Q3LI77 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP13-4Q3LI77 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP13-4Q3LI77 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
KRTAP13-4Q3LI77 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
KRTAP13-4Q3LI77 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
KRTAP13-4Q3LI77 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
KRTAP13-4Q3LI77 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
KRTAP13-4Q3LI77 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
KRTAP13-4Q3LI77 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
KRTAP13-4Q3LI77 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
KRTAP13-4Q3LI77 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
KRTAP13-4Q3LI77 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
KRTAP13-4Q3LI77 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
KRTAP13-4Q3LI77 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms