Protein–RNA interactions for Protein: Q33E94

RFX4, Transcription factor RFX4, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX4Q33E94 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFX4Q33E94 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms