Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CSPP1Q1MSJ5 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CSPP1Q1MSJ5 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms