Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KNOP1Q1ED39 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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