Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NDUFA9Q16795 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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NDUFA9Q16795 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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NDUFA9Q16795 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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NDUFA9Q16795 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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