Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF239Q16600 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms