Protein–RNA interactions for Protein: Q16527

CSRP2, Cysteine and glycine-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP2Q16527 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSRP2Q16527 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
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