Protein–RNA interactions for Protein: Q15050

RRS1, Ribosome biogenesis regulatory protein homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRS1Q15050 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RRS1Q15050 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RRS1Q15050 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RRS1Q15050 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RRS1Q15050 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RRS1Q15050 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRS1Q15050 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRS1Q15050 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRS1Q15050 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RRS1Q15050 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RRS1Q15050 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RRS1Q15050 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRS1Q15050 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRS1Q15050 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRS1Q15050 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRS1Q15050 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRS1Q15050 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRS1Q15050 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRS1Q15050 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRS1Q15050 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRS1Q15050 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRS1Q15050 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRS1Q15050 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRS1Q15050 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRS1Q15050 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRS1Q15050 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRS1Q15050 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RRS1Q15050 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRS1Q15050 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRS1Q15050 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRS1Q15050 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRS1Q15050 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRS1Q15050 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRS1Q15050 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRS1Q15050 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRS1Q15050 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRS1Q15050 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRS1Q15050 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRS1Q15050 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRS1Q15050 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRS1Q15050 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRS1Q15050 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRS1Q15050 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRS1Q15050 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRS1Q15050 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRS1Q15050 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRS1Q15050 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRS1Q15050 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRS1Q15050 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRS1Q15050 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRS1Q15050 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRS1Q15050 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRS1Q15050 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRS1Q15050 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRS1Q15050 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRS1Q15050 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRS1Q15050 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRS1Q15050 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRS1Q15050 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRS1Q15050 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRS1Q15050 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRS1Q15050 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRS1Q15050 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRS1Q15050 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRS1Q15050 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRS1Q15050 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRS1Q15050 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRS1Q15050 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRS1Q15050 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRS1Q15050 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRS1Q15050 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRS1Q15050 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRS1Q15050 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRS1Q15050 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRS1Q15050 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RRS1Q15050 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRS1Q15050 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RRS1Q15050 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRS1Q15050 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRS1Q15050 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRS1Q15050 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRS1Q15050 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRS1Q15050 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRS1Q15050 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRS1Q15050 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRS1Q15050 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRS1Q15050 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRS1Q15050 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRS1Q15050 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRS1Q15050 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRS1Q15050 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRS1Q15050 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RRS1Q15050 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRS1Q15050 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRS1Q15050 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRS1Q15050 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRS1Q15050 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRS1Q15050 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRS1Q15050 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RRS1Q15050 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms