Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
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