Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMD6Q15008 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
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