Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
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