Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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