Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CKAP5Q14008 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CKAP5Q14008 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms