Protein–RNA interactions for Protein: Q13946

PDE7A, High affinity cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7A, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7AQ13946 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
PDE7AQ13946 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PDE7AQ13946 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms