Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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DNASE1L3Q13609 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
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DNASE1L3Q13609 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DNASE1L3Q13609 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms