Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BFSP2Q13515 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
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