Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
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TCIRG1Q13488 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TCIRG1Q13488 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
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TCIRG1Q13488 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
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TCIRG1Q13488 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
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TCIRG1Q13488 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
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TCIRG1Q13488 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
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