Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SRSF5Q13243 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF5Q13243 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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