Protein–RNA interactions for Protein: Q13131

PRKAA1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA1Q13131 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRKAA1Q13131 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRKAA1Q13131 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRKAA1Q13131 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRKAA1Q13131 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRKAA1Q13131 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRKAA1Q13131 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRKAA1Q13131 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRKAA1Q13131 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRKAA1Q13131 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRKAA1Q13131 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRKAA1Q13131 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRKAA1Q13131 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRKAA1Q13131 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRKAA1Q13131 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRKAA1Q13131 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRKAA1Q13131 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRKAA1Q13131 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRKAA1Q13131 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRKAA1Q13131 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRKAA1Q13131 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRKAA1Q13131 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRKAA1Q13131 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRKAA1Q13131 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRKAA1Q13131 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRKAA1Q13131 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRKAA1Q13131 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRKAA1Q13131 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRKAA1Q13131 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRKAA1Q13131 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRKAA1Q13131 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PRKAA1Q13131 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRKAA1Q13131 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRKAA1Q13131 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRKAA1Q13131 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRKAA1Q13131 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRKAA1Q13131 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRKAA1Q13131 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRKAA1Q13131 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRKAA1Q13131 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRKAA1Q13131 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PRKAA1Q13131 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRKAA1Q13131 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRKAA1Q13131 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRKAA1Q13131 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRKAA1Q13131 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRKAA1Q13131 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRKAA1Q13131 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRKAA1Q13131 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PRKAA1Q13131 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PRKAA1Q13131 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRKAA1Q13131 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRKAA1Q13131 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PRKAA1Q13131 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRKAA1Q13131 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRKAA1Q13131 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRKAA1Q13131 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRKAA1Q13131 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRKAA1Q13131 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRKAA1Q13131 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PRKAA1Q13131 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PRKAA1Q13131 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRKAA1Q13131 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRKAA1Q13131 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRKAA1Q13131 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRKAA1Q13131 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRKAA1Q13131 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRKAA1Q13131 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRKAA1Q13131 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRKAA1Q13131 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRKAA1Q13131 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRKAA1Q13131 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRKAA1Q13131 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRKAA1Q13131 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRKAA1Q13131 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRKAA1Q13131 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRKAA1Q13131 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PRKAA1Q13131 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRKAA1Q13131 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRKAA1Q13131 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRKAA1Q13131 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRKAA1Q13131 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRKAA1Q13131 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRKAA1Q13131 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRKAA1Q13131 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PRKAA1Q13131 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRKAA1Q13131 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRKAA1Q13131 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRKAA1Q13131 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRKAA1Q13131 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRKAA1Q13131 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRKAA1Q13131 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRKAA1Q13131 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRKAA1Q13131 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRKAA1Q13131 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRKAA1Q13131 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRKAA1Q13131 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRKAA1Q13131 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRKAA1Q13131 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRKAA1Q13131 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms