Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PTPN13Q12923 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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