Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
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