Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
NIPAL4Q0D2K0 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NIPAL4Q0D2K0 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms