Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms