Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTDSPL2Q05D32 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms