Protein–RNA interactions for Protein: Q04771

ACVR1, Activin receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1Q04771 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACVR1Q04771 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACVR1Q04771 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACVR1Q04771 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACVR1Q04771 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACVR1Q04771 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACVR1Q04771 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACVR1Q04771 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACVR1Q04771 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACVR1Q04771 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ACVR1Q04771 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ACVR1Q04771 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ACVR1Q04771 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACVR1Q04771 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACVR1Q04771 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ACVR1Q04771 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACVR1Q04771 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACVR1Q04771 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ACVR1Q04771 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACVR1Q04771 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACVR1Q04771 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACVR1Q04771 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACVR1Q04771 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACVR1Q04771 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACVR1Q04771 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACVR1Q04771 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACVR1Q04771 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACVR1Q04771 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACVR1Q04771 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACVR1Q04771 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACVR1Q04771 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACVR1Q04771 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACVR1Q04771 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACVR1Q04771 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACVR1Q04771 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACVR1Q04771 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACVR1Q04771 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACVR1Q04771 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACVR1Q04771 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACVR1Q04771 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACVR1Q04771 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACVR1Q04771 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACVR1Q04771 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACVR1Q04771 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ACVR1Q04771 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ACVR1Q04771 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACVR1Q04771 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACVR1Q04771 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACVR1Q04771 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACVR1Q04771 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ACVR1Q04771 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACVR1Q04771 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACVR1Q04771 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACVR1Q04771 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACVR1Q04771 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACVR1Q04771 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACVR1Q04771 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACVR1Q04771 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACVR1Q04771 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACVR1Q04771 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACVR1Q04771 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACVR1Q04771 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACVR1Q04771 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACVR1Q04771 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACVR1Q04771 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACVR1Q04771 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACVR1Q04771 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACVR1Q04771 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACVR1Q04771 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACVR1Q04771 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACVR1Q04771 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACVR1Q04771 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACVR1Q04771 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACVR1Q04771 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACVR1Q04771 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACVR1Q04771 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACVR1Q04771 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ACVR1Q04771 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACVR1Q04771 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACVR1Q04771 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACVR1Q04771 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACVR1Q04771 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACVR1Q04771 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACVR1Q04771 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACVR1Q04771 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ACVR1Q04771 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACVR1Q04771 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ACVR1Q04771 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACVR1Q04771 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACVR1Q04771 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACVR1Q04771 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACVR1Q04771 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACVR1Q04771 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ACVR1Q04771 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACVR1Q04771 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACVR1Q04771 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACVR1Q04771 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACVR1Q04771 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACVR1Q04771 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACVR1Q04771 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms