Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRF8Q02556 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms