Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

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Length 133 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
IFITM3Q01628 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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