Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SKOR1P84550 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SKOR1P84550 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms