Protein–RNA interactions for Protein: P78347

GTF2I, General transcription factor II-I, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IP78347 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2IP78347 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2IP78347 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2IP78347 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2IP78347 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GTF2IP78347 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GTF2IP78347 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2IP78347 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2IP78347 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2IP78347 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2IP78347 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2IP78347 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2IP78347 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2IP78347 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2IP78347 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2IP78347 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2IP78347 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2IP78347 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2IP78347 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2IP78347 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2IP78347 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2IP78347 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2IP78347 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2IP78347 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2IP78347 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2IP78347 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2IP78347 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2IP78347 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2IP78347 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2IP78347 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2IP78347 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2IP78347 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2IP78347 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2IP78347 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2IP78347 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2IP78347 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2IP78347 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2IP78347 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2IP78347 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2IP78347 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2IP78347 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2IP78347 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2IP78347 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2IP78347 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2IP78347 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2IP78347 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2IP78347 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2IP78347 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2IP78347 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2IP78347 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2IP78347 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2IP78347 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2IP78347 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2IP78347 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2IP78347 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2IP78347 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2IP78347 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2IP78347 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2IP78347 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2IP78347 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2IP78347 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2IP78347 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2IP78347 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2IP78347 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2IP78347 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2IP78347 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2IP78347 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2IP78347 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2IP78347 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2IP78347 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2IP78347 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2IP78347 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2IP78347 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2IP78347 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2IP78347 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2IP78347 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2IP78347 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2IP78347 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2IP78347 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2IP78347 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2IP78347 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2IP78347 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2IP78347 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2IP78347 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2IP78347 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2IP78347 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2IP78347 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2IP78347 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2IP78347 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2IP78347 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2IP78347 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2IP78347 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2IP78347 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2IP78347 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2IP78347 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2IP78347 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2IP78347 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2IP78347 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2IP78347 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2IP78347 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms